脱線事故の影響で田中～上田～戸倉が運休しているしなの鉄道線（長野県）は復旧作業が進み、6月15日に全線再開することが決まった。
ただし6月15日から当面のあいだ、一部列車の運休と臨時列車の運行を行う。しなの鉄道によると、運休列車と臨時列車は次の通り（6月14日13時時点の計画）。
●運休列車（下り）
特別快速「しなのサンライズ号」：小諸7時07分発→長野7時59分着
特別快速「しなのサンセット1号」：上田19時05分発→長野19時35分着
●運休列車（上り）
特別快速「しなのサンセット2号」：長野18時25分発→上田18時54分着
特別快速「しなのサンセット4号」：長野19時48分発→上田20時17分着
●臨時列車
普通列車：小諸7時07分→上田7時28分着・7時36分発→長野8時22分着
※小諸→上田は「しなのサンライズ号」と同時刻で臨時運転
※上田→長野は定期列車
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