羽田空港で1月2日夕方、航空機衝突事故の影響で滑走路が閉鎖され、同空港を離着陸する便の欠航やダイバート（ほかの空港への代替着陸）が相次いだ。これを受けて地上の鉄道・バス各社は臨時便を運行した。
JR東海は事故発生後、客の混雑が見込まれるとして、東海道新幹線で臨時列車「のぞみ269号」（東京21時42分→新大阪0時03分）と「のぞみ262号」（新大阪21時50分→東京0時11分）の運行を急きょ決めた。
2023～2024年の年末年始の「のぞみ」は20年ぶりに全車指定席で運行されているが、全席指定席で運行しているが、「のぞみ269・262号」はグリーン車を除き全車自由席とし、グリーン車は車内発売とした。
新千歳空港から羽田空港に向かっていた航空便の一部は、事故を受け茨城空港にダイバートした。関東鉄道によると、同社グループの関鉄バスと関鉄グリーンバスが茨城空港にバス車両を派遣。ダイバートで茨城空港に到着した客を21時10分ごろまでに、すべて常磐線の石岡駅への案内を完了したという。
事故は1月2日17時47分ごろに発生。新千歳空港15時50分発の日本航空516便（エアバスA350-941）が羽田空港のC滑走路に着陸中、海上保安庁の小型機「みずなぎ1号」（ボンバルディアDHC-8-Q300）に衝突し、炎上した。516便の乗客乗員は全員脱出したが、「みずなぎ1号」の乗員6人のうち機長を除く5人が死亡した。羽田空港は全滑走路が閉鎖されたが、C滑走路を除き21時30分に再開している。
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