JRの一部の旅客会社は、新型コロナウイルスの発生に伴う切符の取り扱いに関する案内を始めた。
JR東日本・JR東海・JR西日本・JR四国の案内を総合すると、次のいずれかの理由で旅行を中止する場合、切符の払い戻しが行われる。手数料は不要だ。
（1）外務省による新型コロナウイルスに関する渡航中止勧告または退避勧告の発出
（2）新型コロナウイルスに罹患
（3）新型コロナウイルスの感染拡大防止を目的にイベント等が中止、延期または規模縮小等が決定
（4）新型コロナウイルスへの感染防止
無手数料での払い戻しの対象となる切符は普通乗車券、特急券、グリーン券、指定席券など。割引切符はフリーパスタイプのものは使用開始前に限る。旅行会社が発売する旅行商品は、購入先の旅行会社に問い合わせてほしいとしている。
また、チケットレスに対応したネット予約サービス「モバイルSuica（スイカ）特急券」「新幹線eチケット」「スマートEX」などは、それぞれのサポートセンターに問い合わせるか、会員向けサイトを確認するよう案内している。